Школа была создана в 1974 году. Решением исполнительного комитета Смоленской областного совета депутатов трудящихся № 519 от 10 сентября 1974 гола средней школе № 3 города Гагарин было присвоено имя Ленинского комсомола.
Дата создания образовательной организации -19 октября 1992 г. (Постановление)
В настоящее время школа функционирует как муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение «Средняя школа №3 имени Ленинского комсомола» (краткое наименование МБОУ "Средняя школа №3") и осуществляет свою деятельность на основании Устава школы.